Cancer incidences

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Bienvenue sur la page du projet BD4Cancer qui focalise sur l'incidence des cancers. Cette page donne accès à des statistiques et à des ressources sur la l'incidences des cancers.


Objectifs de cette page

Cette page vise à centraliser les ressources et résultats sur l'incidence pour chaque type de cancer.

Mots clés en Français: incidence, taux d'incidence.

Mots clés en anglais: incidence, incidence rate.

Incidences des cancers en France

Fig. 1 Classement des cancers par incidence projetée en 2015 en France métropolitaine par localisations selon le sexe (source Partenariat Francim-HCL-InVS-INCa [Leone N, 2015]).
Le rapport "Cancer en France 2015" a inclus les projections d’incidence (Fig. 1) et de mortalité par cancer en France métropolitaine pour l’année 2015  (Leone, 2015)

Données fournies par Epidemium

Epidemium a fourni a jeu de données 'data.core.zip' sur l'incidence et la mortalité de 1950 à 2012. La première colonne permet d'identifier le cancer (codification ICD-10). La correspondance code/type du cancer est donnée dans le fichier cancer.txt (dans la même archive zip).

La troisième colonne donne les tranches d'âges (attention lorsque l'on ouvre ce fichier dans Excel, certaines données se transforment en dates). Il y a 19 tranches d'âges: 0-4 10-14 15-19 20-24 25-29 30-34 35-39 40-44 45-49 50-54 55-59 5-9 60-64 65-69 70-74 75-79 80-84 85+

La quatrième colonne donne le pays. Un fichier localite.txt est fourni dans cette même archive qui permet de faire la correspondance entre le pays et la localité. La dernière colonne (cases.number) donne le nombre de décès.

Un script R pour lire et filtrer ces données est disponible sur le Github d'Epidemium.


Taux d'incidence du cancer

En épidémiologie, le taux d'incidence (Incidence Rates) est le nombre de nouveaux cas observés dans une population donnée, divisé par la taille de cette population et la durée de la période d'observation

Taux d'incidence = (Nouveau cancers / Population) × 100,000

Ressources

 Librairies R utiles pour l'épidémiologie

  • epiDisplay (Epidemiological Data Display Package)
  • demography (Forecasting mortality, fertility, migration and population data
  • epiR (Tools for the Analysis of Epidemiological Data)
  • StMoMo (Stochastic Mortality Modelling)
  • ilc (Lee-Carter Mortality Models using Iterative Fitting Algorithms)
  • LifeMetrics (implements the original Cairns-Blake-Dowd (CBD))